จากรายงานประเด็นศาลปกครองมีคำสั่งให้กรุงเทพมหานคร (กทม.) และบริษัท กรุงเทพธนาคม จำกัด (KT) จ่ายค่าจ้างเดินรถรถไฟฟ้าสายสีเขียวที่ค้างชำระให้กับ บมจ.ระบบขนส่งมวลชนกรุงเทพ (BTSC) โดยส่วนต่อขยาย 1 เป็นจำนวนเงินต้น 2,199 ล้านบาท ดอกเบี้ย 149.5 ล้านบาท  และส่วนต่อขยาย 2 เงินต้น 8,786 ล้านบาท ดอกเบี้ย 619.65 ล้านบาท โดยให้ชำระภายใน 180 วันนั้น


โดยในคดีนี้ BTSC ฟ้อง กทม.และ KT ผิดสัญญาการชำระค่าจ้างการให้บริการเดินรถและซ่อมบำรุง โครงการระบบขนส่งมวลชนกรุงเทพมหานคร (รถไฟฟ้าสายสีเขียว) ส่วนต่อขยายที่ 1 ช่วงสะพานตากสิน-บางหว้า และ ช่วงอ่อนนุช-แบริ่ง  กับส่วนต่อขยายที่ 2 ช่วงหมอชิต-สะพานใหม่-คูคต และช่วงแบริ่ง-สมุทรปราการ


ในส่วนต่อขยายที่ 1 นั้น KT หยุดจ่ายค่าจ้างเดินรถตั้งแต่เดือน พ.ค.62-พ.ค.64 จากปกติที่จะจ่ายทุกวันที่ 20 ของเดือนถัดไป ทำให้มีหนี้คงค้างที่เป็นส่วนเงินต้น 2,199 ล้านบาท และ ดอกเบี้ย 149.5 ล้านบาท คิดในอัตรา MLR +1% รวมมูลหนี้ 2,348 ล้านบาท


ส่วนต่อขยายที่ 2 กทม.และ KT ยังไม่ได้เก็บค่าโดยสาร นับตั้งแต่เริ่มเปิดให้บริการ ตั้งแต่ เม.ย.60 -พ.ค.64  จึงยังไม่ชำระค่าจ้างตามสัญญา ทำให้เป็นหนี้คงค้างเงินต้น 8,786  ล้านบาท และดอกเบี้ย 619.5 ล้านบาท รวมมูลค่า  9,406 ล้านบาท ซึ่งให้เริ่มคิดดอกเบี้ยวันที่ตรวจรับงาน หรือหลังวันที่ 20 ของเดือนถัดไป


ทั้งนี้ศาลฯ ระบุว่า กทม.ต้องร่วมรับผิดชอบกับ KT ซึ่งเป็นวิสาหกิจของ กทม.ที่ถือหุ้นอยู่ 99.98% และ กทม.สนับสนุนการชำระค่าจ้างเดินรถและซ่อมบำรุงตามสัญญา ดังนั้น กทม.และ KT จึงต้องร่วมกันชำระค่าจ้างเดินรถและค่าซ่อมบำรุงรถไฟฟ้าสายสีเขียวส่วนต่อขยายที่ 1 และส่วนต่อขยายที่ 2 รวมมูลค่า 11,754 ล้านบาท (รวมดอกเบี้ย) โดยชำระให้แล้วเสร็จภายในระยะเวลา 180 วัน


ล่าสุดมุมมองของนักวิเคราะห์บล.โนมูระ พัฒนสิน ออกมาประเมินว่า จากประเด็นดังกล่าวมองบวกต่อ BTS โดยโอกาสเจรจากับทาง กทม.มากขึ้นในอนาคต ส่วนกรณีศาลคาดว่า กทม.จะยื่นอุทธรณ์ศาลปกครองสูงสุดต่อไป